在有機(jī)肥的制作生產(chǎn)過(guò)程中，首先解決也是比較重要的問(wèn)題就是堆肥。堆肥作為傳統(tǒng)的生物肥處理技術(shù)，經(jīng)過(guò)多年來(lái)的發(fā)展和改進(jìn)，正朝著機(jī)械化、商品化方向發(fā)展。尤其是近年來(lái)，鄭州程翔重工將堆肥發(fā)酵微生物作為研究對(duì)象，開發(fā)出一系列堆肥發(fā)酵特殊微生物，使堆肥效率明顯提高，并且避免了傳統(tǒng)堆肥過(guò)程中出現(xiàn)的臭味和霉變，以及對(duì)環(huán)境造成的二次污染等問(wèn)題，這將是以后
有機(jī)肥設(shè)備發(fā)展的首要方向。在堆肥處理方法中，生物處理法是近年研究較多的一種方法，其中以有氧發(fā)酵為主。這種方法具有成本低、發(fā)酵產(chǎn)物生物活性強(qiáng)、肥效高、易于推廣的特點(diǎn)，同時(shí)達(dá)到了去臭、滅菌的目的。
一般認(rèn)為，堆肥化是在微生物的作用下通過(guò)發(fā)酵使有機(jī)物礦質(zhì)化、腐殖化和無(wú)害化而變成腐熟肥料的過(guò)程，在微生物分解有機(jī)質(zhì)的過(guò)程中，不但生成大量可被植物吸收的有效態(tài)氮、磷、鉀等化合物，而且又合成新的高分子化合物——腐殖質(zhì)，它是構(gòu)成土壤肥力的重要活性物質(zhì)。
堆肥是指在一定的條件下，通過(guò)微生物的作用，使畜禽糞便、作物秸稈或食用菌廢糠等可降解的有機(jī)物經(jīng)過(guò)發(fā)酵、腐熟等過(guò)程，不斷被降解和穩(wěn)定，并產(chǎn)生出一種適宜于土地利用的產(chǎn)品的過(guò)程。堆肥過(guò)程中也可以通過(guò)添加微生物發(fā)酵劑或采用工廠化方法控制堆制條件以加快堆肥的進(jìn)程，提高堆肥質(zhì)量。
堆肥一般分為好氧堆肥和厭氧堆肥兩種。好氧堆肥是在有氧的情況下有機(jī)物料分解的過(guò)程，其代謝產(chǎn)物主要是二氧化碳、水和熱；厭氧堆肥是在無(wú)氧的條件下有機(jī)物料分解的過(guò)程，其主要產(chǎn)物是甲烷、二氧化碳和許多低分子量的中間產(chǎn)物，如有機(jī)酸等。厭氧堆肥和好氧堆肥相比較，單位質(zhì)量的有機(jī)質(zhì)降解產(chǎn)生的能量較少，而且厭氧堆肥通常容易發(fā)出臭味。由于這些原因，目前大部分堆肥工程系統(tǒng)都采用好氧堆肥。
上圖：生物肥發(fā)酵設(shè)備（槽式翻拋機(jī)）
